Resumen
Introducción: Anoectochilus formosanus es una orquídea herbácea muy valiosa, conocida por su eficacia en el tratamiento de una amplia gama de enfermedades. Sin embargo, los métodos actuales utilizados para diferenciar esta especie de otras dentro del mismo género no son efectivos debido a la gran similitud en las características morfológicas y las secuencias de códigos de barras de ADN entre estas especies.
Objetivo: Caracterizar el genoma del cloroplasto (cp) para distinguir A. formosanus a nivel de especie o de aislamiento.
Métodos: El genoma completo del cp se secuenció utilizando tecnología de secuenciación de nueva generación, se anotó y se comparó con los genomas del cp publicados de varias especies del género Anoectochilus.
Resultados: El genoma del cp completo de A. formosanus tiene un tamaño de 152 658 pb y consta de una copia grande y pequeña de 82 692 pb y 17 346 pb, respectivamente, separadas por repeticiones invertidas de 26 310 pb. Dentro del genoma del cp, hay un total de 141 genes, incluidos 92 genes codificadores de proteínas, 10 genes de ARNr y 39 genes de ARNt. Este genoma contiene un total de 80 repeticiones de secuencia simple, con 50 repeticiones largas. Mediante análisis filogenético, se observó una estrecha relación entre A. formosanus de Vietnam y muestras de A. formosanus de China (NC_061756.1). Sin embargo, las comparaciones genómicas resaltaron diferencias entre los dos genomas del cp, específicamente en sus secuencias de repetición invertida.
Conclusión: Estos hallazgos revelan distintas variaciones en el genoma del cp de A. formosanus en Vietnam, lo que ofrece información valiosa sobre la taxonomía, la identificación de plantas, la reproducción y los programas de conservación relacionados con esta hierba en Vietnam.
Palabras clave: Anoectochilus formosanus; genoma del cloroplasto; planta medicinal; secuenciación de próxima generación; repetición de secuencia simple.